Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP4P49662 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP4P49662 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP4P49662 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP4P49662 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP4P49662 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP4P49662 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP4P49662 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP4P49662 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP4P49662 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP4P49662 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP4P49662 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP4P49662 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP4P49662 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP4P49662 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP4P49662 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP4P49662 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP4P49662 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms