Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARSP49589 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARSP49589 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARSP49589 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CARSP49589 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CARSP49589 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CARSP49589 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARSP49589 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CARSP49589 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CARSP49589 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CARSP49589 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CARSP49589 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CARSP49589 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CARSP49589 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms