Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms