Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALDH1A3P47895 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALDH1A3P47895 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A3P47895 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms