Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms