Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR4P46093 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR4P46093 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPR4P46093 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPR4P46093 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPR4P46093 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR4P46093 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR4P46093 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR4P46093 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR4P46093 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR4P46093 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms