Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MKI67P46013 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MKI67P46013 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MKI67P46013 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKI67P46013 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKI67P46013 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKI67P46013 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKI67P46013 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKI67P46013 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKI67P46013 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKI67P46013 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKI67P46013 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKI67P46013 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKI67P46013 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms