Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCG1P45844 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCG1P45844 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms