Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN9P43378 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN9P43378 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN9P43378 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms