Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEA3P43357 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms