Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPD2P43304 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPD2P43304 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPD2P43304 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPD2P43304 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPD2P43304 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPD2P43304 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPD2P43304 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GPD2P43304 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPD2P43304 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPD2P43304 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPD2P43304 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPD2P43304 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPD2P43304 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPD2P43304 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPD2P43304 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms