Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGIRP43119 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGIRP43119 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms