Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRCPP42785 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRCPP42785 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRCPP42785 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRCPP42785 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRCPP42785 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRCPP42785 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRCPP42785 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRCPP42785 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRCPP42785 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRCPP42785 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRCPP42785 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRCPP42785 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRCPP42785 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRCPP42785 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRCPP42785 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRCPP42785 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRCPP42785 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRCPP42785 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRCPP42785 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRCPP42785 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRCPP42785 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRCPP42785 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRCPP42785 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRCPP42785 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRCPP42785 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms