Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL35P42766 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL35P42766 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL35P42766 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL35P42766 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL35P42766 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL35P42766 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL35P42766 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL35P42766 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL35P42766 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL35P42766 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL35P42766 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms