Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA2P42765 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA2P42765 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms