Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP8P40818 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP8P40818 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP8P40818 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP8P40818 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP8P40818 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP8P40818 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP8P40818 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP8P40818 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP8P40818 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP8P40818 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP8P40818 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP8P40818 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms