Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL1P40616 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL1P40616 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL1P40616 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL1P40616 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARL1P40616 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARL1P40616 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARL1P40616 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARL1P40616 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms