Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THPOP40225 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THPOP40225 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THPOP40225 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THPOP40225 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THPOP40225 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THPOP40225 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THPOP40225 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THPOP40225 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THPOP40225 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THPOP40225 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THPOP40225 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
THPOP40225 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THPOP40225 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THPOP40225 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THPOP40225 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms