Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP12P39900 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP12P39900 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP12P39900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP12P39900 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MMP12P39900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP12P39900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP12P39900 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP12P39900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP12P39900 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP12P39900 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP12P39900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms