Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPARGP37231 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPARGP37231 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPARGP37231 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPARGP37231 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPARGP37231 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPARGP37231 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms