Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
POLR2IP36954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POLR2IP36954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2IP36954 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms