Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBRP36941 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBRP36941 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBRP36941 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBRP36941 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBRP36941 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBRP36941 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBRP36941 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBRP36941 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBRP36941 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBRP36941 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBRP36941 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms