Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5C1P36542 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5C1P36542 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms