Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHKAP35790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHKAP35790 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHKAP35790 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHKAP35790 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHKAP35790 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHKAP35790 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHKAP35790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHKAP35790 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHKAP35790 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHKAP35790 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHKAP35790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHKAP35790 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHKAP35790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHKAP35790 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms