Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDIT3P35638 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDIT3P35638 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms