Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT9P35527 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT9P35527 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT9P35527 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT9P35527 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT9P35527 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT9P35527 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT9P35527 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT9P35527 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT9P35527 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT9P35527 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT9P35527 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT9P35527 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT9P35527 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT9P35527 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT9P35527 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT9P35527 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms