Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA4P35212 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA4P35212 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJA4P35212 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJA4P35212 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA4P35212 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA4P35212 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA4P35212 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA4P35212 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms