Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms