Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLIP1P30622 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CLIP1P30622 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
CLIP1P30622 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLIP1P30622 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms