Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMOD1P29536 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMOD1P29536 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms