Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP1P29466 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP1P29466 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP1P29466 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP1P29466 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP1P29466 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP1P29466 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP1P29466 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms