Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF8P28908 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF8P28908 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms