Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PTPRMP28827 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRMP28827 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
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