Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HLA-DMAP28067 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms