Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IL3RAP26951 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IL3RAP26951 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms