Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLNP26678 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLNP26678 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLNP26678 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLNP26678 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLNP26678 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLNP26678 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLNP26678 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLNP26678 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLNP26678 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLNP26678 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLNP26678 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PLNP26678 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms