Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VARSP26640 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VARSP26640 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VARSP26640 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VARSP26640 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VARSP26640 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VARSP26640 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VARSP26640 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VARSP26640 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VARSP26640 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms