Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IVDP26440 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IVDP26440 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IVDP26440 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IVDP26440 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IVDP26440 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IVDP26440 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IVDP26440 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IVDP26440 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IVDP26440 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IVDP26440 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IVDP26440 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms