Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA3P25788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMA3P25788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMA3P25788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms