Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA2P24043 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA2P24043 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA2P24043 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms