Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPREP23469 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPREP23469 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPREP23469 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPREP23469 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPREP23469 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPREP23469 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPREP23469 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPREP23469 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPREP23469 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPREP23469 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPREP23469 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPREP23469 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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