Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRBP23467 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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