Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPAP23025 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPAP23025 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPAP23025 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPAP23025 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPAP23025 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPAP23025 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPAP23025 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPAP23025 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPAP23025 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPAP23025 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPAP23025 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPAP23025 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPAP23025 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPAP23025 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPAP23025 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPAP23025 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPAP23025 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPAP23025 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms