Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PVALBP20472 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PVALBP20472 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PVALBP20472 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PVALBP20472 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PVALBP20472 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PVALBP20472 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PVALBP20472 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PVALBP20472 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PVALBP20472 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PVALBP20472 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PVALBP20472 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms