Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB6P18564 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB6P18564 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB6P18564 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms