Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRAP18433 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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