Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERCC2P18074 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms