Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEBPBP17676 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms