Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPD1P17405 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms