Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPB42P16452 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPB42P16452 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPB42P16452 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPB42P16452 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPB42P16452 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPB42P16452 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EPB42P16452 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EPB42P16452 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EPB42P16452 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPB42P16452 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPB42P16452 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPB42P16452 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPB42P16452 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPB42P16452 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPB42P16452 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPB42P16452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EPB42P16452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms